El objetivo principal del Plan Director Global, se orienta a establecer el control, conservación y uso adecuado de los múltiples recursos del sistema, fundamentalmente el hídrico y el hidrobiológico del Sistema TDPS, sin afectar negativamente el ecosistema de la región, considerando las posibilidades de utilización conjunta o individual de esos recursos por parte de Bolivia y el Perú.
La Autoridad Binacional Autónoma del Sistema Hídrico del Lago Titicaca, Río Desaguadero, Lago Poopó, Salar de Coipasa, es una entidad de derecho público internacional, depende funcionalmente de los Ministerios de Relaciones Exteriores del Perú y Bolivia.